Hva som ble funnet
Anthropic meldte 23. september at Claude har identifisert et hittil ukarakterisert enzymsystem i DNA hos bakteriofager, virusene som infiserer bakterier. Selskapet kaller det matriseassosierte revers transkriptaser, ART.
Et ART-system har tre deler: et revers transkriptase, et følgegen og en matrise av jevnt fordelte DNA-repetisjoner som ligner en CRISPR-matrise. Det er likheten som er interessant. Repetisjonsmatrisene er det som gjør CRISPR programmerbart, og en repetisjonsmatrise ved siden av et uvanlig revers transkriptase er en struktur ingen hadde katalogisert.
Søket arbeidet i den skalaen som er hele poenget. Claude-agenter gikk gjennom en DNA-sekvensdatabase, samlet mer enn 200 000 revers transkriptaser, merket rundt 3 500 kandidatsystemer og snevret dem inn til tjue som fortjente nærmere ettersyn. Én agent oppdaget det gjentakende mønsteret ved siden av det uvanlige genet. Anthropic anslår totalen til rundt 950 agenter, omtrent 21 timer og 210 millioner tokens.
Hva Anthropic ikke hevder
Selskapet er uvanlig nøye med grensene, og det er i grensene historien ligger.
Claude utførte ingen forsøk. Alt vått laboratoriearbeid — å uttrykke proteinet i standard laboratoriestammer og karakterisere det biokjemisk — ble gjort av menneskelige forskere i Anthropics laboratorium i San Francisco-området, som åpnet i vår og bare arbeider på biosikkerhetsnivå 1 og 2, uten humane patogener.
Funksjonen er ikke kjent. Tidlige forsøk viste at ART-matrisen uttrykkes som distinkte korte RNA-molekyler, som er hva man ville vente om systemet var programmerbart på CRISPR-vis. Anthropics egen formulering er at «vi vet ennå ikke hva funksjonen er».
Og det er ikke uten forløpere. Toppsjef Dario Amodei sa at systemet ble funnet «for det meste, men ikke helt, av Claude», og erkjente at forskere ved Stanford tidligere har beskrevet et system som på noen måter ligner.
Hvorfor dette teller som et resultat
Feng Zhang ved MIT, en av dem som gjorde CRISPR til et verktøy, kalte det «et spennende eksempel på hvordan KI-agenter kan bidra til biologisk oppdagelse». Det er en støtte til metoden snarere enn til enzymet, og det er det riktige å støtte på dette stadiet.
Det metoden gjorde, var et sammenlignende genomikksveip i en skala en forskergruppe ikke ville forsøke for hånd, fulgt av en vurdering av hvilke tjue av 3 500 kandidater som fortjente benketid. Ingen av halvdelene ligger utenfor rekkevidden til menneskelige forskere. Kombinasjonen, gjort på et døgn, er ny.
Anthropic har publisert et fortrykk og inviterer utenforstående grupper til å foreslå funksjonsstudier. Den invitasjonen er den ærlige delen av kunngjøringen, og den er også prøven. En struktur som ligner CRISPR og produserer korte RNA kan vise seg å være et programmerbart system, en forsvarsmekanisme uten anvendelse, eller noe midt imellom. Hvilken av dem avgjøres i andres laboratorier i løpet av det neste året, ikke i et selskapsinnlegg.
