Vad som utlovats
Biohub, den forskningsstiftelse som stöds av Mark Zuckerberg och Priscilla Chan, meddelade den 7 oktober att dess initiativ för virtuell biologi nått 1,8 miljarder dollar i åtaganden, räknat som pengar, data, beräkning och mätteknik snarare än enbart kontanter.
USA:s energidepartement skjuter till mer än 500 miljoner dollar över fem år för laboratoriemätning, modellering och beräkning, genom sitt Genesis-uppdrag. Hälsoinstituten NIH tillför inga nya pengar men samordnar dataset och arkiv byggda med mer än 500 miljoner dollar i tidigare federala investeringar, som Biohub ska standardisera för AI-träning.
Biohubs eget grundåtagande från april är 500 miljoner dollar: omkring 400 miljoner till ny mät- och ingenjörsteknik och 100 miljoner till forskning utanför den egna organisationen. Google DeepMind, Meta och läkemedelsbolaget Isomorphic Labs bidrar tillsammans med 300 miljoner.
Målet är en cell man kan köra
Målet initiativet återkommer till är en modell som förutsäger hur en cell svarar på ett ingrepp — ett läkemedel, en genredigering, en miljöförändring — i långt fler celltyper och tillstånd än någon har mätt.
Alex Rives, Biohubs vetenskapschef, kallar det en av de viktigaste utmaningarna för vetenskapens nästa era. Max Jaderberg, ordförande för Isomorphic Labs, beskrev sitt bolags deltagande som ett bidrag till att bygga en stor multimodal datagrund. Darío Gil, energidepartementets understatssekreterare för vetenskap, kallade upplägget en ny standard för öppen vetenskap.
Varför pengarna går till mätning
Det intressanta med utgifterna är vart de pekar. Ungefär 400 miljoner dollar av Biohubs eget åtagande finansierar instrument — teknik som vidgar vad biologer kan mäta, i större skala, snabbare och noggrannare — inte modellträning.
Det är ett tydligt påstående om var flaskhalsen sitter. Språkmodellerna hade webben; proteinstrukturprediktion hade Protein Data Bank. En modell för cellsvar saknar motsvarande korpus, eftersom de flesta ingrepp i de flesta celltyper aldrig har utförts. Stämmer diagnosen följer beräkningen efter data i stället för att gå före.
Nvidia bidrar med accelererad beräkning och kompetens, utan angiven siffra. Som partner nämns också Renaissance Philanthropy, Allen Institute, Broad Institute, Gladstone Institutes, Human Cell Atlas, Human Protein Atlas och Wellcome Sanger Institute.
Frågan om tillgång
Biohub beskriver resultatet som öppet för forskarsamhället, med gemensamma standarder, gemensamma identifierare och en enda ingång. Någon licens eller detaljerade villkor anges inte.
The Decoder rapporterar, med hänvisning till Reuters, ett villkor som meddelandet inte nämner: kommersiella finansiärer skulle få ett års exklusiv tillgång till de data de betalat för innan de blir offentliga, medan offentligt finansierat arbete inte bär någon sådan begränsning. Samma rapport placerar det första datasetet ungefär ett år bort.
Vad man ska följa
Tre saker visar om detta är en dataallmänning eller ett konsortium. Om licensen, när den publiceras, tillåter kommersiell återanvändning. Om ensamrätten på ett år gäller per dataset eller per finansiär. Och om de standardiserade NIH-arkiven kommer i en form som ett laboratorium utanför partnerlistan faktiskt kan träna på, vilket är skillnaden mellan öppna data och data som bara är tillgängliga.
