Google DeepMind publicó el 30 de septiembre en Nature un método para poner marcas de agua en proteínas diseñadas por IA. SynthID Bio es una familia de técnicas que entreteje una señal estadística tenue tanto en la secuencia de aminoácidos como en la estructura tridimensional prevista de una proteína diseñada, sin comprometer de forma apreciable su estabilidad, su función ni la velocidad de generarla.
El problema que aborda es la procedencia. Los modelos de diseño de proteínas son ya lo bastante buenos como para que una secuencia que llega a un proveedor de síntesis de ADN no traiga ninguna indicación fiable de si la escribió una persona o un modelo. Los proveedores de cribado comparan las secuencias encargadas con bases de datos de peligros conocidos, lo que funciona con lo ya catalogado y no con diseños nuevos.
Qué hace el método
En lugar de añadir una etiqueta, la marca de agua guía la generación: se empuja al modelo hacia elecciones de aminoácidos que llevan un patrón estadístico detectable sin dejar de producir una proteína que se pliega y funciona. DeepMind informa de que las proteínas diseñadas conservan estabilidad estructural y eficacia funcional, y de que la velocidad de generación no se ve afectada de forma significativa.
La empresa lo está emparejando con la práctica en lugar de dejarlo en un artículo. Tiene un acuerdo con Twist Bioscience para integrar la detección de la marca en el cribado de síntesis de ADN, que es donde una marca así resulta realmente útil: en el momento en que se cursa un pedido.
La limitación se expone sin rodeos
La marca puede borrarse. La pieza informativa que acompaña al artículo en Nature señala que quien quiera eliminarla puede, en muchos casos, pasar una proteína marcada por otra herramienta de diseño y obtener una secuencia nueva que mantiene estructura y función mientras pierde la señal. Eso convierte esto en una herramienta de procedencia para el caso cooperativo, no en un control frente a un actor decidido.
Aun así merece la pena. La mayoría de las secuencias que llegan a un proveedor de síntesis no las envía un actor decidido, y un cribado capaz de decir de dónde salió un diseño reduce el conjunto que necesita mirada humana.
Qué vigilar
Si otros laboratorios de diseño de proteínas adoptan un esquema de marcado compatible, y si algún regulador de bioseguridad empieza a mencionar las marcas de agua en las guías de cribado en vez de dejarlo en manos de los proveedores.
